Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx2P81066 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms