Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx2P80206 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx2P80206 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx2P80206 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms