Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb13P70321 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms