Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux2P70298 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms