Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms