Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkn1P70268 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms