Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pcp4P63054 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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