Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms