Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd1P62315 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms