Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vbp1P61759 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vbp1P61759 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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