Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ActbP60710 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ActbP60710 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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