Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms