Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms