Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms