Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms