Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd4P58467 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms