Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms