Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpdl3bP58242 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms