Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samsn1P57725 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms