Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TdgP56581 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TdgP56581 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TdgP56581 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TdgP56581 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TdgP56581 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms