Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms