Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcanP55066 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcanP55066 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcanP55066 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcanP55066 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcanP55066 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NcanP55066 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcanP55066 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcanP55066 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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