Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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