Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA4P52798 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA4P52798 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA4P52798 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms