Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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