Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms