Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms