Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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