Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms