Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13P47963 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.9 ms