Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syt1P46096 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms