Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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