Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms