Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TfamP40630 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TfamP40630 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TfamP40630 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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