Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Traf1P39428 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf1P39428 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms