Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1aP36536 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1aP36536 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1aP36536 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sar1aP36536 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms