Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms