Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc3P33622 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms