Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms