Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col2a1P28481 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms