Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa2P28309 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa2P28309 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms