Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja4P28235 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja4P28235 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja4P28235 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gja4P28235 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja4P28235 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja4P28235 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja4P28235 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms