Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Twist1P26687 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Twist1P26687 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms