Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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