Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U2af2P26369 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U2af2P26369 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms