Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms