Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm3473-201ENSMUST00000216911 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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