Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZfaP23607 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZfaP23607 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms