Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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