Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms